Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms