Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms