Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms