Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms