Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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SH3BP2P78314 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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