Protein–RNA interactions for Protein: P62995

TRA2B, Transformer-2 protein homolog beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2BP62995 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRA2BP62995 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms