Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
RPS29P62273 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms