Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms