Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2BFSP57053 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.7 ms