Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEMP55040 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEMP55040 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEMP55040 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEMP55040 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEMP55040 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEMP55040 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEMP55040 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEMP55040 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEMP55040 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEMP55040 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEMP55040 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEMP55040 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEMP55040 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEMP55040 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEMP55040 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GEMP55040 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEMP55040 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEMP55040 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEMP55040 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEMP55040 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEMP55040 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEMP55040 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEMP55040 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEMP55040 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEMP55040 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEMP55040 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEMP55040 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEMP55040 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEMP55040 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEMP55040 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEMP55040 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEMP55040 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GEMP55040 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GEMP55040 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GEMP55040 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GEMP55040 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GEMP55040 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GEMP55040 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GEMP55040 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GEMP55040 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GEMP55040 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GEMP55040 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GEMP55040 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GEMP55040 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GEMP55040 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GEMP55040 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GEMP55040 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GEMP55040 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GEMP55040 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GEMP55040 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GEMP55040 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GEMP55040 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GEMP55040 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GEMP55040 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GEMP55040 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GEMP55040 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GEMP55040 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GEMP55040 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GEMP55040 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GEMP55040 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GEMP55040 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GEMP55040 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GEMP55040 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GEMP55040 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GEMP55040 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GEMP55040 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GEMP55040 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GEMP55040 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GEMP55040 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GEMP55040 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GEMP55040 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEMP55040 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms