Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMPOP42166 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMPOP42166 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMPOP42166 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMPOP42166 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMPOP42166 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMPOP42166 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMPOP42166 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMPOP42166 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMPOP42166 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMPOP42166 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMPOP42166 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMPOP42166 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMPOP42166 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMPOP42166 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMPOP42166 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMPOP42166 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TMPOP42166 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMPOP42166 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMPOP42166 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMPOP42166 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMPOP42166 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMPOP42166 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMPOP42166 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TMPOP42166 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMPOP42166 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMPOP42166 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMPOP42166 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMPOP42166 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMPOP42166 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMPOP42166 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMPOP42166 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMPOP42166 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMPOP42166 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMPOP42166 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMPOP42166 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMPOP42166 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMPOP42166 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMPOP42166 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMPOP42166 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMPOP42166 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMPOP42166 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMPOP42166 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TMPOP42166 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMPOP42166 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TMPOP42166 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TMPOP42166 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TMPOP42166 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TMPOP42166 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMPOP42166 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMPOP42166 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMPOP42166 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMPOP42166 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TMPOP42166 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TMPOP42166 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMPOP42166 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TMPOP42166 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMPOP42166 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TMPOP42166 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMPOP42166 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TMPOP42166 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TMPOP42166 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMPOP42166 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMPOP42166 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMPOP42166 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMPOP42166 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMPOP42166 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TMPOP42166 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMPOP42166 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMPOP42166 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMPOP42166 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMPOP42166 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMPOP42166 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMPOP42166 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMPOP42166 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMPOP42166 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMPOP42166 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMPOP42166 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMPOP42166 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMPOP42166 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMPOP42166 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMPOP42166 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMPOP42166 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMPOP42166 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMPOP42166 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMPOP42166 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMPOP42166 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMPOP42166 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TMPOP42166 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMPOP42166 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMPOP42166 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TMPOP42166 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMPOP42166 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMPOP42166 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMPOP42166 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMPOP42166 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMPOP42166 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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