Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms