Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB2P29033 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB2P29033 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB2P29033 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB2P29033 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB2P29033 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB2P29033 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB2P29033 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJB2P29033 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJB2P29033 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJB2P29033 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJB2P29033 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJB2P29033 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJB2P29033 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GJB2P29033 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJB2P29033 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJB2P29033 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJB2P29033 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJB2P29033 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJB2P29033 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJB2P29033 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJB2P29033 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJB2P29033 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GJB2P29033 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJB2P29033 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJB2P29033 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GJB2P29033 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJB2P29033 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJB2P29033 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJB2P29033 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJB2P29033 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJB2P29033 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJB2P29033 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJB2P29033 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJB2P29033 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GJB2P29033 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJB2P29033 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJB2P29033 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJB2P29033 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJB2P29033 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJB2P29033 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJB2P29033 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJB2P29033 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJB2P29033 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJB2P29033 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJB2P29033 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJB2P29033 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJB2P29033 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJB2P29033 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJB2P29033 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJB2P29033 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
GJB2P29033 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJB2P29033 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJB2P29033 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJB2P29033 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJB2P29033 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJB2P29033 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJB2P29033 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJB2P29033 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJB2P29033 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJB2P29033 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJB2P29033 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJB2P29033 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJB2P29033 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJB2P29033 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJB2P29033 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJB2P29033 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJB2P29033 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJB2P29033 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJB2P29033 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJB2P29033 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJB2P29033 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJB2P29033 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJB2P29033 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJB2P29033 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJB2P29033 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GJB2P29033 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJB2P29033 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJB2P29033 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJB2P29033 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJB2P29033 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJB2P29033 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJB2P29033 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJB2P29033 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJB2P29033 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJB2P29033 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJB2P29033 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJB2P29033 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJB2P29033 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJB2P29033 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJB2P29033 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJB2P29033 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJB2P29033 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJB2P29033 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJB2P29033 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJB2P29033 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GJB2P29033 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJB2P29033 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJB2P29033 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJB2P29033 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms