Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms