Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSSP25774 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSSP25774 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSSP25774 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSSP25774 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSSP25774 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSSP25774 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSSP25774 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSSP25774 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSSP25774 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSSP25774 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSSP25774 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSSP25774 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSSP25774 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSSP25774 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSSP25774 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSSP25774 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSSP25774 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSSP25774 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSSP25774 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSSP25774 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSSP25774 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSSP25774 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSSP25774 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSSP25774 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSSP25774 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSSP25774 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSSP25774 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSSP25774 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSSP25774 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSSP25774 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSSP25774 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSSP25774 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSSP25774 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSSP25774 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSSP25774 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSSP25774 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSSP25774 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSSP25774 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSSP25774 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSSP25774 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSSP25774 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSSP25774 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSSP25774 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSSP25774 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSSP25774 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSSP25774 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSSP25774 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSSP25774 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSSP25774 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSSP25774 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSSP25774 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSSP25774 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSSP25774 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSSP25774 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSSP25774 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSSP25774 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSSP25774 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSSP25774 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSSP25774 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSSP25774 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSSP25774 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSSP25774 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSSP25774 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSSP25774 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSSP25774 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSSP25774 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSSP25774 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSSP25774 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSSP25774 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSSP25774 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSSP25774 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSSP25774 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSSP25774 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSSP25774 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSSP25774 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSSP25774 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSSP25774 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSSP25774 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSSP25774 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSSP25774 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSSP25774 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSSP25774 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSSP25774 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSSP25774 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSSP25774 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSSP25774 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSSP25774 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSSP25774 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSSP25774 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSSP25774 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSSP25774 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSSP25774 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSSP25774 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSSP25774 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSSP25774 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSSP25774 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSSP25774 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSSP25774 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSSP25774 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms