Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms