Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARF4P18085 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARF4P18085 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARF4P18085 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARF4P18085 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARF4P18085 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARF4P18085 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARF4P18085 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARF4P18085 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARF4P18085 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARF4P18085 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARF4P18085 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARF4P18085 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARF4P18085 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARF4P18085 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARF4P18085 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARF4P18085 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARF4P18085 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARF4P18085 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF4P18085 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF4P18085 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF4P18085 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF4P18085 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF4P18085 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF4P18085 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF4P18085 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF4P18085 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF4P18085 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF4P18085 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF4P18085 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF4P18085 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF4P18085 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF4P18085 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF4P18085 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF4P18085 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF4P18085 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF4P18085 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF4P18085 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF4P18085 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF4P18085 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF4P18085 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF4P18085 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF4P18085 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF4P18085 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF4P18085 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF4P18085 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF4P18085 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF4P18085 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF4P18085 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF4P18085 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF4P18085 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF4P18085 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF4P18085 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF4P18085 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF4P18085 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF4P18085 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF4P18085 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF4P18085 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF4P18085 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF4P18085 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF4P18085 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF4P18085 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF4P18085 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF4P18085 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF4P18085 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF4P18085 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF4P18085 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF4P18085 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF4P18085 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF4P18085 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF4P18085 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF4P18085 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF4P18085 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF4P18085 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF4P18085 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF4P18085 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF4P18085 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF4P18085 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF4P18085 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF4P18085 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF4P18085 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF4P18085 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF4P18085 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF4P18085 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF4P18085 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF4P18085 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF4P18085 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF4P18085 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF4P18085 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF4P18085 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF4P18085 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF4P18085 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF4P18085 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF4P18085 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF4P18085 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF4P18085 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF4P18085 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF4P18085 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF4P18085 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF4P18085 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms