Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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