Protein–RNA interactions for Protein: P04424

ASL, Argininosuccinate lyase, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASLP04424 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASLP04424 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASLP04424 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASLP04424 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASLP04424 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASLP04424 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASLP04424 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASLP04424 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASLP04424 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASLP04424 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASLP04424 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASLP04424 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASLP04424 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASLP04424 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASLP04424 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ASLP04424 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ASLP04424 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASLP04424 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASLP04424 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ASLP04424 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASLP04424 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASLP04424 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASLP04424 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASLP04424 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASLP04424 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASLP04424 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASLP04424 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASLP04424 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASLP04424 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASLP04424 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASLP04424 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASLP04424 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASLP04424 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASLP04424 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASLP04424 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASLP04424 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASLP04424 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASLP04424 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASLP04424 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASLP04424 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASLP04424 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASLP04424 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASLP04424 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASLP04424 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms