Protein–RNA interactions for Protein: O96020

CCNE2, G1/S-specific cyclin-E2, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE2O96020 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNE2O96020 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms