Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

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Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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UBXN7O94888 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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UBXN7O94888 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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UBXN7O94888 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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UBXN7O94888 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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UBXN7O94888 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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UBXN7O94888 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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UBXN7O94888 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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UBXN7O94888 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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UBXN7O94888 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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