Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NBNO60934 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NBNO60934 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NBNO60934 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NBNO60934 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NBNO60934 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NBNO60934 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NBNO60934 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NBNO60934 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NBNO60934 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NBNO60934 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NBNO60934 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NBNO60934 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NBNO60934 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NBNO60934 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NBNO60934 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NBNO60934 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBNO60934 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBNO60934 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms