Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms