Protein–RNA interactions for Protein: O15212

PFDN6, Prefoldin subunit 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN6O15212 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN6O15212 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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