Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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BCKDKO14874 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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BCKDKO14874 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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