Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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