Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E9PBE3 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E9PBE3 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E9PBE3 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E9PBE3 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E9PBE3 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E9PBE3 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
E9PBE3 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E9PBE3 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E9PBE3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E9PBE3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E9PBE3 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E9PBE3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E9PBE3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
E9PBE3 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E9PBE3 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E9PBE3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E9PBE3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E9PBE3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
E9PBE3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E9PBE3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E9PBE3 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E9PBE3 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E9PBE3 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E9PBE3 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E9PBE3 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E9PBE3 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E9PBE3 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E9PBE3 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E9PBE3 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E9PBE3 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E9PBE3 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E9PBE3 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E9PBE3 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E9PBE3 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E9PBE3 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E9PBE3 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E9PBE3 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E9PBE3 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E9PBE3 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E9PBE3 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E9PBE3 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E9PBE3 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E9PBE3 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E9PBE3 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E9PBE3 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E9PBE3 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E9PBE3 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E9PBE3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E9PBE3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E9PBE3 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E9PBE3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E9PBE3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E9PBE3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E9PBE3 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
E9PBE3 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
E9PBE3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E9PBE3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E9PBE3 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E9PBE3 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
E9PBE3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E9PBE3 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
E9PBE3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
E9PBE3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E9PBE3 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E9PBE3 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E9PBE3 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E9PBE3 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E9PBE3 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E9PBE3 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E9PBE3 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E9PBE3 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E9PBE3 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E9PBE3 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E9PBE3 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E9PBE3 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E9PBE3 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
E9PBE3 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E9PBE3 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E9PBE3 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E9PBE3 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E9PBE3 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E9PBE3 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E9PBE3 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E9PBE3 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E9PBE3 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E9PBE3 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms