Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms