Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms