Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SNX13Q9Y5W8 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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SNX13Q9Y5W8 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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