Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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USP20Q9Y2K6 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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USP20Q9Y2K6 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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USP20Q9Y2K6 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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USP20Q9Y2K6 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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USP20Q9Y2K6 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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USP20Q9Y2K6 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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USP20Q9Y2K6 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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USP20Q9Y2K6 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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