Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.9 ms