Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms