Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DSEQ9UL01 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms