Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJB4Q9UDY4 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms