Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms