Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SH3BP4Q9P0V3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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SH3BP4Q9P0V3 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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SH3BP4Q9P0V3 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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