Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms