Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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GDE1Q9NZC3 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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