Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms