Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms