Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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