Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEMA4CQ9C0C4 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms