Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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FOXQ1Q9C009 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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FOXQ1Q9C009 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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FOXQ1Q9C009 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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