Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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LRRC3Q9BY71 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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LRRC3Q9BY71 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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LRRC3Q9BY71 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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