Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms