Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms