Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms