Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 EBF1-201ENST00000313708 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 REST-208ENST00000619101 7114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 NKAP-201ENST00000371410 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 MAN2B2-201ENST00000285599 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 DPYSL5-201ENST00000288699 5209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 TBL1X-206ENST00000424279 5451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 HYOU1-217ENST00000612687 4360 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 NR3C2-203ENST00000358102 5893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 ATP13A2-203ENST00000452699 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 CPPED1-202ENST00000381774 6273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 ZNF142-205ENST00000449707 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms