Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TIMM29Q9BSF4 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TIMM29Q9BSF4 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms